RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 CPED1A4D0V7 1026 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TRABD2BA6NFA1 517 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 E5RI56 91 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GP1BAP07359 652 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MYF5P13349 255 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 BRAFP15056 766 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PNLIPP16233 465 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GABRB3P28472 473 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FASLGP48023 281 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MAZP56270 477 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC3Q13217 504 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NAB1Q13506 487 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF549Q6P9A3 640 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 XKR5Q6UX68 686 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 OTOAQ7RTW8 1153 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TMPRSS12Q86WS5 348 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SFTPA2Q8IWL1 248 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC37A2Q8TED4 501 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PATE1Q8WXA2 126 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNJ9Q92806 393 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MIEF2Q96C03 454 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CPNE1Q99829 537 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 WWP1Q9H0M0 922 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52A5Q9H2C5 316 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TXNDC16Q9P2K2 825 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ASPMQ8IZT6 3477 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RHPN2P1A8MT19 583 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZW10O43264 779 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NIPSNAP2O75323 286 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GPC4O75487 556 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 F7P08709 466 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM153BP0C7A2 387 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ACADVLP49748 655 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PMS2P54278 862 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CLCA4Q14CN2 919 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM153CQ494X1 144 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT3A1Q6NUS8 523 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GUSBP11Q6P575 273 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 C19orf48Q6RUI8 117 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 DHRS13Q6UX07 377 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CTAGE3PQ8IX95 158 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 IFI44Q8TCB0 444 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ITFG2Q969R8 447 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 LRIT1Q9P2V4 623 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CPNE7Q9UBL6 633 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMD13Q9UNM6 376 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RAXQ9Y2V3 346 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF215Q9Y6U7 377 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS26AO75436 327 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RFPL3O75679 317 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLCO2B1O94956 709 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ACSL3O95573 720 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 VIPP01282 170 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 C1QAP02745 245 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CD9P21926 228 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC19A1P41440 591 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PREPP48147 710 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 E2F1Q01094 437 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 HHEXQ03014 270 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPA14Q0VDF9 509 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RPE65Q16518 533 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 COL28A1Q2UY09 1125 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TTLL9Q3SXZ7 439 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF438Q7Z4V0 828 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PDZD3Q86UT5 571 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MARCH9Q86YJ5 346 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RMDN2Q96LZ7 410 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 C12orf66Q96MD2 445 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CYTH2Q99418 400 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms