RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA24Q86W54 205 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDSS2Q86YH6 399 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPXM2Q8N436 756 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTERQ96BW5 349 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIEF2Q96C03 454 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINGO1Q96FE5 620 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 EXOC2Q96KP1 924 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDRT15Q96T59 188 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR21Q99679 349 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD274Q9NZQ7 290 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB26Q9ULW5 256 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 INVSQ9Y283 1065 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0J9YYE9 177 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM233B4DJY2 109 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 H0YJX3 145 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBXN8O00124 270 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 NR5A2O00482 541 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIP5K1BO14986 540 aa6.2□□□□□ -1.42
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SHQ1P1-201ENST00000437111 TSPAN3O60637 253 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJA2O60884 412 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZMPSTE24O75844 475 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 PGLSO95336 258 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ESRRBO95718 433 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 OLFM2O95897 454 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIRTP0C851 137 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 FCGR1AP12314 374 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 UQCRBP14927 111 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHRM3P20309 590 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 MSH3P20585 1137 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCKDHBP21953 392 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 DGKAP23743 735 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMAN2Q12907 356 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYTH1Q15438 398 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR33Q49SQ1 333 aa6.2□□□□□ -1.42
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SHQ1P1-201ENST00000437111 UNC50Q53HI1 259 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM198Q66K66 360 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANO7Q6IWH7 933 aa6.2□□□□□ -1.42
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SHQ1P1-201ENST00000437111 TTC23LQ6PF05 361 aa6.2□□□□□ -1.42
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SHQ1P1-201ENST00000437111 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNX20Q7Z614 316 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPSM1Q86YR5 675 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 LEMD2Q8NC56 503 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIPK4Q8NE63 616 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDI1Q8WTU0 396 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRG4Q8WWG1 115 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIGKQ92643 395 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM136AQ96C01 138 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ULK4Q96C45 1275 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHFRQ96EP1 664 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRELD1Q96HD1 420 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 GBP5Q96PP8 586 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC3Q9BY71 257 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASAH2Q9NR71 780 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAD18Q9NS91 495 aa6.2□□□□□ -1.42
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