RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSTPIP1O43586 416 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPM3P06753 285 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RALBP11234 206 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAPSNQ13702 412 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCUN1D1Q96GG9 259 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FICDQ9BVA6 458 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBA3Q9H227 469 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5AR2Q9P296 337 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRLS1Q9UJA2 301 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FER1L5A0AVI2 2057 aa12.77□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITPR2Q14571 2701 aa12.77□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP14A8MT82 685 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HACD1B0YJ81 288 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTN3A3O00478 584 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K7O43318 606 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGTP01019 485 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GEMP55040 296 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XIAPP98170 497 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM14Q14142 442 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFDP3Q5H9I0 405 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGPREQ86SM8 312 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCKQ8N0W5 287 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ULK4Q96C45 1275 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf60Q96EN9 201 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCTN2Q96GX1 697 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FERD3LQ96RJ6 166 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHP1Q99653 195 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GORASP1Q9BQQ3 440 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHRS4Q9BTZ2 278 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COG4Q9H9E3 785 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD10Q9NUJ1 306 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERTAD3Q9UJW9 196 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRHDEQ9UKU6 1024 aa12.77□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf60A6NFR6 353 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP99D6REC4 459 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF749O43361 778 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT86O43790 486 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN1O95832 211 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDLRP01130 860 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HBQ1P09105 142 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PVRP15151 417 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGXTP21549 392 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTX2P32243 289 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCEAL1Q15170 157 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR6A1Q15406 480 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KYNUQ16719 465 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF787Q6DD87 383 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXPE1Q8N323 547 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13C4Q8NGS5 318 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC42Q96M95 316 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IP6K3Q96PC2 410 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPS8Q99627 209 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRTNQ99748 197 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL25Q9H0H3 589 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52A5Q9H2C5 316 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa12.76□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC66A2RUB6 948 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WIPF3A6NGB9 483 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf74A8MZ97 194 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANXA9O76027 345 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGALP20701 1170 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL8A1P27658 744 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADRA1AP35348 466 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HADHAP40939 763 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLIG2Q13516 323 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SARM1Q6SZW1 724 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX20Q7Z614 316 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMIGO1Q86WK6 493 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC50Q8IVM0 306 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KATNAL2Q8IYT4 538 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEXDCQ8WVB3 486 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C17orf62Q9BQA9 187 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOL2Q9BQE5 337 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HGH1Q9BTY7 390 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM96AQ9H5X1 160 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASF1BQ9NVP2 202 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.75□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTUQ9ULD6 942 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms