RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GVT2 93 aa16.55■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM24O75264 130 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CATP04040 527 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPN2P04844 631 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP2A7P20853 494 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTR1BP42025 376 aa16.55■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CTSKP43235 329 aa16.55■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTR1AP61163 376 aa16.55■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.55■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A9Q8IVM8 553 aa16.55■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.55■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 WWP1Q9H0M0 922 aa16.55■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.54■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 BPGMP07738 259 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H2ADP20671 130 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 AP1S2P56377 157 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDKL1Q00532 357 aa16.54■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC61Q9BV99 259 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT4Q9NZJ9 180 aa16.54■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.53■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SUPT3HO75486 399 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf105O95561 183 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 S100BP04271 92 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTHFD2P13995 350 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC2A4P14672 509 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPIAP49247 311 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKAA2P54646 552 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFKB2Q00653 900 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHKG1Q16816 387 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF19Q2TAC6 998 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC23LQ6PF05 361 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLG3Q92796 817 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 OXSMQ9NWU1 459 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD274Q9NZQ7 290 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDE10AQ9Y233 779 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASF1AQ9Y294 204 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 A6NCN8 305 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5K4A6NMS3 321 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 FFAR2O15552 330 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 DFNA5O60443 496 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLX3O60479 287 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX2O60749 519 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPN2O95208 641 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANXA5P08758 320 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 F3P13726 295 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 GFAPP14136 432 aa16.52■□□□□ 0.24
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