RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF12Q96QT6 1004 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LGMNQ99538 433 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 REEP1Q9H902 201 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GLOD4Q9HC38 313 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MIOSQ9NXC5 875 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GDE1Q9NZC3 331 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MAB21L2Q9Y586 359 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 URADA6NGE7 173 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SSX5O60225 188 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF682O95780 498 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RLN1P04808 185 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PCCBP05166 539 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ALADP13716 330 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HSD3B1P14060 373 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ADRA1DP25100 572 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SOAT1P35610 550 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINB5P36952 375 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SCNN1AP37088 669 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ETV5P41161 510 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CSKP41240 450 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CEBPGP53567 150 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SMIM11AP58511 58 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 IL2P60568 153 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 IL10RBQ08334 325 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 OVGP1Q12889 678 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RUNX3Q13761 415 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DPYSL3Q14195 570 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 AGKQ53H12 422 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF567Q8N184 647 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MIER2Q8N344 545 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC9A6Q92581 669 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 REPS1Q96D71 796 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PGM2Q96G03 612 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF145Q96MT1 663 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF570Q96NI8 536 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GAL3ST1Q99999 423 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CST11Q9H112 138 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TREM1Q9NP99 234 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 THAP1Q9NVV9 213 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ARL15Q9NXU5 204 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MEMO1Q9Y316 297 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFAF1Q9Y375 327 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MGAT4DA6NG13 374 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PLD2O14939 933 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 EPHB6O15197 1021 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS4BO75351 444 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 OAZ2O95190 189 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NDST3O95803 873 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NPPAP01160 153 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LINGO3P0C6S8 592 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LBPP18428 481 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TEX44Q53QW1 395 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NPNTQ6UXI9 565 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 UTS2BQ765I0 119 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KBTBD6Q86V97 674 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC26A11Q86WA9 606 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HPS6Q86YV9 775 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RBFAQ8N0V3 343 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SMYD1Q8NB12 490 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 METTL6Q8TCB7 284 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB2BQ8WUD1 216 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM3CQ92520 227 aa4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms