RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MAGEB16A2A368 324 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ANTXRLA6NF34 631 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NDUFAB1O14561 156 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TM9SF1O15321 606 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SH3BP5O60239 455 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 AVILO75366 819 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 STC2O76061 302 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TBX18O95935 607 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PEX11BO96011 259 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 JCHAINP01591 159 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 POLBP06746 335 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.362e-20■□□□□ 11.1
CCL20-202ENST00000409189 MGAT1P26572 445 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NPY2RP49146 381 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DPTQ07507 201 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC3Q13217 504 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF460Q14592 562 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN26Q16670 478 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ALFQ53S48 1182 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SDE2Q6IQ49 451 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CASC4Q6P4E1 433 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TMC8Q8IU68 726 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TEX26Q8N6G2 289 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ASB15Q8WXK1 588 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 IGSF8Q969P0 613 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HMCESQ96FZ2 354 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CERS2Q96G23 380 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MAGEH1Q9H213 219 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TRABDQ9H4I3 376 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PDFQ9HBH1 243 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 GLOD4Q9HC38 313 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MPP6Q9NZW5 540 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 OBSL1O75147 1896 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 KNL1Q8NG31 2342 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 BSNQ9UPA5 3926 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ILVBLA1L0T0 632 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TYROBPO43914 113 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF11O60813 436 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HMBSP08397 361 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 OR1E1P30953 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PTGER3P43115 390 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SLC7A9P82251 487 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 IL9RQ01113 521 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MGAT5Q09328 741 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LMAN2Q12907 356 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MTM1Q13496 603 aa6.52□□□□□ -1.37
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