RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	OR2T12	Q8NG77	320 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	FOXJ1	Q92949	421 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	UBE2F	Q969M7	185 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	NCLN	Q969V3	563 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ASB2	Q96Q27	587 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF382	Q96SR6	550 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	HACD3	Q9P035	362 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918		K7EPI3	171 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	STX16	O14662	325 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	KDELR3	O43731	214 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	HS6ST1	O60243	411 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	MTX2	O75431	263 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	FUCA1	P04066	466 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	THRB	P10828	461 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	GGT1	P19440	569 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	DCK	P27707	260 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	HTR1E	P28566	365 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	HMOX2	P30519	316 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	PLA2G16	P53816	162 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	CASP9	P55211	416 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	CD47	Q08722	323 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	PLD1	Q13393	1074 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	SPIDR	Q14159	915 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	KIAA0040	Q15053	153 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	DET1	Q7L5Y6	550 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	APCDD1	Q8J025	514 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	NETO1	Q8TDF5	533 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	GTF2H4	Q92759	462 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	TSSK3	Q96PN8	268 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	SEC22B	O75396	215 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	GLUD1	P00367	558 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ANXA6	P08133	673 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	CDH1	P12830	882 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	CRHBP	P24387	322 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	FMO3	P31513	532 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	MAP2K4	P45985	399 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	TTPA	P49638	278 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	DAG1	Q14118	895 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ARHGEF7	Q14155	803 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	GPNMB	Q14956	572 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	FATE1	Q969F0	183 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	BDH2	Q9BUT1	245 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	MAGEH1	Q9H213	219 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	P2RY12	Q9H244	342 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF186	Q9NXI6	227 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	IL17C	Q9P0M4	197 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	FNIP2	Q9P278	1114 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	LHX3	Q9UBR4	397 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF639	Q9UID6	485 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		6.9	□□□□□ -1.3
CAGE1-203	ENST00000379918		G3V2T6	193 aa		6.9	□□□□□ -1.3

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