RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 WRBO00258 174 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CCNB2O95067 398 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 DNASE1L3Q13609 305 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 STYXQ8WUJ0 223 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CCDC115Q96NT0 180 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM129BQ96TA1 746 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CDH22Q9UJ99 828 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CLDN4O14493 209 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 LRCH4O75427 683 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CLPXO76031 633 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ACP5P13686 325 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TFAP2BQ92481 460 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MAFFQ9ULX9 164 aa14.51□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 OR7A10O76100 309 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GDF10P55107 478 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RAB25P57735 213 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM192Q8IY95 271 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CPT1BQ92523 772 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 IFT46Q9NQC8 304 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLIT1O75093 1534 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ALOX15BO15296 676 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PLIN3O60664 434 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NDST3O95803 873 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NAT14Q8WUY8 206 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SERPINA3P01011 423 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FMO3P31513 532 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CRHR1P34998 444 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 C1QTNF8P60827 252 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CA9Q16790 459 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 IL7RP16871 459 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 C5orf22Q49AR2 442 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 COX18Q8N8Q8 333 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NCSTNQ92542 709 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MIOSQ9NXC5 875 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 C9J4A7 227 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FSCN2O14926 492 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ABHD2P08910 425 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TGFBR2P37173 567 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 IDNKQ5T6J7 187 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.5□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TNFRSF10BO14763 440 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ITGB1P05556 798 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RNF220Q5VTB9 566 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MPP5Q8N3R9 675 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 C5orf60A6NFR6 353 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GBAP04062 536 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PTPN2P17706 415 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 HSD3B2P26439 372 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 LINGO2Q7L985 606 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 IFT27Q9BW83 186 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GPR68Q15743 365 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.49□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms