RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336708.11

TRIM16-201, Transcript of tripartite motif containing 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM16, Length 2,900 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16-201ENST00000336708 CHRNA6Q15825 494 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 NXPE1Q8N323 547 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 SFRP1Q8N474 314 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 DPP10Q8N608 796 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ZBTB2Q8N680 514 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ANKFN1Q8N957 763 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 SCRN2Q96FV2 425 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ACOX2Q99424 681 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 EBF1Q9UH73 591 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ANKRD28O15084 1053 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 LRG1P02750 347 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 IL12AP29459 219 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 EPHA5P54756 1037 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 UFM1P61960 85 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 GBX1Q14549 363 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 GPR26Q8NDV2 337 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ESAMQ96AP7 390 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CENPOQ9BU64 300 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 THEGQ9P2T0 379 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ARNTLO00327 626 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 KIAA0355O15063 1070 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CBFA2T3O75081 653 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 OTCP00480 354 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 BMP2P12643 396 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 C21orf59P57076 290 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 KCNK10P57789 538 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CDKL1Q00532 357 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 ITGADQ13349 1161 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 RPS6KA2Q15349 733 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CARTPTQ16568 116 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 FUT11Q495W5 492 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 TTC23LQ6PF05 361 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 PLPP6Q8IY26 295 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 CD244Q9BZW8 370 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 TRIM15Q9C019 465 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 IRAK3Q9Y616 596 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-201ENST00000336708 GIPC1O14908 333 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 C8AP07357 584 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 CAPN1P07384 714 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 CSF2RAP15509 400 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 UGT1A6P19224 532 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 CDH3P22223 829 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 UGT1A1P22309 533 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 UGT1A4P22310 534 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 HLA-FP30511 346 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 UGT1A3P35503 534 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 UGT1A5P35504 534 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 HTR6P50406 440 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 NR1H2P55055 460 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRIM16-201ENST00000336708 PTSQ03393 145 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms