RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 HERVK_113Q902F9 699 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 FEM1AQ9BSK4 669 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 C9JVG2 144 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 OR10H2O60403 315 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC159P0C7I6 412 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CSF2RAP15509 400 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SLC32A1Q9H598 525 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RAB26Q9ULW5 256 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CDC7O00311 574 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 HSD17B2P37059 387 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 C1orf21Q9H246 121 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PHF24Q9UPV7 400 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 STX16O14662 325 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CMPK1P30085 196 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 DLG1Q12959 904 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC66Q68CR7 880 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CIB1Q99828 191 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MYL12BO14950 172 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PGLSO95336 258 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 VIPP01282 170 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SPIBQ01892 262 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MATN2O00339 956 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 LY6G5CQ5SRR4 150 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC80Q76M96 950 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 Q96MT0 163 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 BTBD9Q96Q07 612 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 VPS35Q96QK1 796 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SLC28A2O43868 658 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ITGB1P05556 798 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 DLDP09622 509 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 COPZ1P61923 177 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 IRF7Q92985 503 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RREB1Q92766 1687 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ATP6V1G1O75348 118 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MAPK12P53778 367 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 NFKB2Q00653 900 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RAB33AQ14088 237 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 GALPQ9UBC7 116 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 FADS3Q9Y5Q0 445 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 NIPAL4Q0D2K0 466 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF544Q6NX49 715 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 NACC2Q96BF6 587 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 EXD2Q9NVH0 621 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TBX10O75333 385 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 IFNA16P05015 189 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CST9Q5W186 159 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 GIPC3Q8TF64 312 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RMI1Q9H9A7 625 aa16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms