RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 RPIAP49247 311 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ACLYP53396 1101 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MVKQ03426 396 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CNTN1Q12860 1018 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SPIDRQ14159 915 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC36A3Q495N2 470 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ERAP2Q6P179 960 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PSME2Q9UL46 239 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PER2O15055 1255 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CKBP12277 381 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PCYT1AP49585 367 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CDH15P55291 814 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ITGADQ13349 1161 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ATP1A4Q13733 1029 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FCGR1BQ92637 280 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PANX1Q96RD7 426 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC32A1Q9H598 525 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GRM6O15303 877 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NDUFS2O75306 463 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ABHD18Q0P651 414 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TRAF3Q13114 568 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SEMA3AQ14563 771 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF605Q86T29 641 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ELMO1Q92556 727 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC29A1Q99808 456 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KRT84Q9NSB2 600 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MYADML2A6NDP7 307 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 VILLO15195 856 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A1O15245 554 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RGS10O43665 173 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MAN1A2O60476 641 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SOCS5O75159 536 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KCNH6Q9H252 994 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DYRK4Q9NR20 520 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SPASTQ9UBP0 616 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ENPP3O14638 875 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FPGTO14772 594 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A5O15375 505 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SUV39H1O43463 412 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CCNDBP1O95273 360 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KRT75O95678 551 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FGF19O95750 216 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ANGPTL1O95841 491 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SERPINA1P01009 418 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ALDH3B2P48448 385 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TRPC1P48995 793 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SP3Q02447 781 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FBXL20Q96IG2 436 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 A0A096LPI6 279 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 A0A0D9SEW6 157 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SNTNA6NMZ2 147 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 AGTR2P50052 363 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NEK2P51955 445 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KCNC3Q14003 757 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PTPRCAPQ14761 206 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RAB39AQ14964 217 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.68□□□□□ -1.02
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