RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 IL37Q9NZH6 218 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 WASF3Q9UPY6 502 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 A0A0X1KG70 313 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ENPP3O14638 875 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SOAT2O75908 522 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PPP2R1BP30154 601 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PEA15Q15121 130 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 KCNA10Q16322 511 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ARMC5Q96C12 935 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 BCO1Q9HAY6 547 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 AIPO00170 330 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 STX16O14662 325 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 AP1G1O43747 822 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SCO2O43819 266 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 IL1R2P27930 398 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PPM1AP35813 382 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GRIA3P42263 894 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ACOT2P49753 483 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 MVKQ03426 396 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 MOB2Q70IA6 237 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 CARFQ8N187 725 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 C12orf29Q8N999 325 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 IPMKQ8NFU5 416 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 BAP1Q92560 729 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TMEM203Q969S6 136 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 OR10A4Q9H209 315 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.65□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 A0A0U1RQJ8 604 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SERPINE1P05121 402 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CBR1P16152 277 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MAGEB1P43366 347 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FHITP49789 147 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 IL18Q14116 193 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MTSS1LQ765P7 747 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SVIPQ8NHG7 77 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DHRS12A0PJE2 317 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 BHLHE40O14503 412 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC31A2O15432 143 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PLA2G6O60733 806 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PTP4A3O75365 173 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ALDH2P05091 517 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ERCC2P18074 760 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RENBPP51606 427 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OSTNP61366 133 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MTM1Q13496 603 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KCNJ11Q14654 390 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP51Q70EK9 711 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OXER1Q8TDS5 423 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LUZP4Q9P127 313 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.65□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MCIDASD6RGH6 385 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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