RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 PIGFQ07326 219 aa25.07■■□□□ 1.6
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RAB40C-201ENST00000248139 NFATC2Q13469 925 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 LRRC73Q5JTD7 316 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 RFLNAQ6ZTI6 216 aa25.07■■□□□ 1.6
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RAB40C-201ENST00000248139 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 OPTCQ9UBM4 332 aa25.06■■□□□ 1.6
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RAB40C-201ENST00000248139 CHRNB3Q05901 458 aa25.05■■□□□ 1.6
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RAB40C-201ENST00000248139 MAGEE1Q9HCI5 957 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 CRLS1Q9UJA2 301 aa25.05■■□□□ 1.6
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RAB40C-201ENST00000248139 C16orf72Q14CZ0 275 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 XKR5Q6UX68 686 aa25.04■■□□□ 1.6
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RAB40C-201ENST00000248139 UPK3BL2E5RIL1 263 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 PFDN1O60925 122 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 ULK1O75385 1050 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 PRKD3O94806 890 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 TFPTP0C1Z6 253 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 COL6A1P12109 1028 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 JAK1P23458 1154 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 DAG1Q14118 895 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB40C-201ENST00000248139 RBFAQ8N0V3 343 aa25.03■■□□□ 1.6
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