RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.97■□□□□ 0.15
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CLN3-255ENST00000637100 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 PREPP48147 710 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 GEMP55040 296 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 PRKAA1Q13131 559 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 RPA4Q13156 261 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 FAM69BQ5VUD6 431 aa15.93■□□□□ 0.14
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