RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR2AG2A6NM03 316 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RB1P06400 928 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UGT1A5P35504 534 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HNF4AP41235 474 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GSSP48637 474 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SCAPQ12770 1279 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF460Q14592 562 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 VITQ6UXI7 678 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PDPRQ8NCN5 879 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL1Q9NR64 748 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PRU2 124 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 STX16O14662 325 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SOCS5O75159 536 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TIPRLO75663 272 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RGS20O76081 388 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NPPAP01160 153 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IGFBP5P24593 272 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4F3Q08477 520 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MORN1Q5T089 497 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TULP2O00295 520 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ASNA1O43681 348 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MGRN1O60291 552 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GSRP00390 522 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CYP11A1P05108 521 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PRG2P13727 222 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EIPR1Q53HC9 387 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 XKR4Q5GH76 650 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PAOXQ6QHF9 649 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AMZ2Q86W34 360 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ENKURQ8TC29 256 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NUAK2Q9H093 628 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC32A1Q9H598 525 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RERGLQ9H628 205 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MKS1Q9NXB0 559 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C9IYK1 514 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AHCYL1O43865 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UGT1A9O60656 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AOC2O75106 756 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RASGRP1O95267 797 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PIK3CBP42338 1070 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 APLP1P51693 650 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ACTR3P61158 418 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NFKB2Q00653 900 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HM13Q8TCT9 377 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HERVK_113Q902F9 699 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SEC14L1Q92503 715 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MCM8Q9UJA3 840 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 A8MT66 165 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 J3KR12 359 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PITPNM1O00562 1244 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CLDN4O14493 209 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ECI2O75521 394 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ADH1BP00325 375 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IFNW1P05000 195 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 THRBP10828 461 aa6.36□□□□□ -1.39
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