RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 CHST8Q9H2A9 424 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 RMI1Q9H9A7 625 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 STOML1Q9UBI4 398 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PCM1Q15154 2024 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 E5RJQ4 531 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MASP2O00187 686 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PDXKO00764 312 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 INSIG1O15503 277 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 UBOX5O94941 541 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PIGNO95427 931 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TPBGLP0DKB5 382 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ZNF24P17028 368 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 NELFEP18615 380 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 GTF2H1P32780 548 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ACADSBP45954 432 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MXI1P50539 228 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SOX8P57073 446 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 KCNJ2P63252 427 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CDK3Q00526 305 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 FOLH1Q04609 750 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ITGA9Q13797 1035 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 STILQ15468 1287 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ADRM1Q16186 407 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ERAP2Q6P179 960 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 LIPIQ6XZB0 460 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MRGPREQ86SM8 312 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 DEFB106AQ8N104 65 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 BCORP1Q8N888 145 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 GBP5Q96PP8 586 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 FAM167BQ9BTA0 163 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa11.44□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 RCCD1A6NED2 376 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 KLHL41O60662 606 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CALCAP01258 141 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MMEP08473 750 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 KRT16P08779 473 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CASP1P29466 404 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 GSTT1P30711 240 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 VHLP40337 213 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 POLD2P49005 469 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MEOX1P50221 254 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 RASSF2P50749 326 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TUBB3Q13509 450 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 HIF1AQ16665 826 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 AFMIDQ63HM1 303 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 KLC3Q6P597 504 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TMEM110Q86TL2 294 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PHC2Q8IXK0 858 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SLC38A9Q8NBW4 561 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 IFT81Q8WYA0 676 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 NR4A3Q92570 626 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MR1Q95460 341 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SH3KBP1Q96B97 665 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 C18orf12Q96KH6 178 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CCDC42Q96M95 316 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 LRFN5Q96NI6 719 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CENPKQ9BS16 269 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TLR10Q9BXR5 811 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 NLNQ9BYT8 704 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PDE7BQ9NP56 450 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PIGVQ9NUD9 493 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 RARRES3Q9UL19 164 aa11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 F8VZ95 297 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PEX11AO75192 247 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 IGSF6O95976 241 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ELFN1P0C7U0 828 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 FOLR1P15328 257 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ECHS1P30084 290 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms