RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ILVBLA1L0T0 632 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC78A2IDD5 438 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 GOLGA8KD6RF30 607 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 E7ESA3 106 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALOX15BO15296 676 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDELR3O43731 214 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIAS1O75925 651 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANXA9O76027 345 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP2A1O95782 977 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGTP01019 485 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 POU2F2P09086 479 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUDT17P0C025 328 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYZAPP0CAP1 466 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TPH1P17752 444 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CD70P32970 193 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHBP35232 272 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CD86P42081 329 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAGEA6P43360 314 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFNAR2P48551 515 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 GEMP55040 296 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPX6P59796 221 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBX1P83916 185 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 NIPAL4Q0D2K0 466 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 LMAN2Q12907 356 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SP140Q13342 867 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNC3Q14003 757 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMED2Q15363 201 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC38Q502W7 563 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTMPQ5BVD1 217 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC8BQ6P9F7 803 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MED25Q71SY5 747 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM25Q86YD3 366 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 APCDD1Q8J025 514 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 IQCKQ8N0W5 287 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 BBS5Q8N3I7 341 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CPXM2Q8N436 756 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MCUQ8NE86 351 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPEARQ8WU66 669 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAX2Q96IS3 184 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 FCRL5Q96RD9 977 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 BBS2Q9BXC9 721 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDFQ9HBH1 243 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 OGFRQ9NZT2 677 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 VPS18Q9P253 973 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 VPS51Q9UID3 782 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCOCQ9UIL1 159 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFS1Q9Y697 457 aa5.49□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYO7AQ13402 2215 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1B0GTW7 788 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 RASGRF2O14827 1237 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSMD3O43242 534 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBX10O75333 385 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMCC1O94876 653 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SUN1O94901 812 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 IVLP07476 585 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABHD2P08910 425 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TYRP14679 529 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARSAP15289 507 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 RGRP47804 291 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 GYS2P54840 703 aa5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAP2BP61225 183 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms