RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1W2PRB8	838 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787		A6NL46	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	AMBP	P02760	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	EDN1	P05305	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC9A3	P48764	834 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SUOX	P51687	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CXCL9	Q07325	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLOD2	O00469	737 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	WISP2	O76076	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	LIF	P15018	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	NR1D1	P20393	614 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	HOXC8	P31273	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC6A6	P31641	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDH11	P55287	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDK3	Q00526	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	STK4	Q13043	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68	9e-6	■■□□□ 12.8
PAPOLA-222	ENST00000556787	MEA1	Q16626	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	MYADM	Q96S97	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	FLT1	P17948	1338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1W2PR77	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZWINT	O95229	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ITGA3	P26006	1051 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATP12A	P54707	1039 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBXN2A	P68543	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANO5	Q75V66	913 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	T	O15178	435 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	MED24	O75448	989 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	GCNT3	O95395	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIGN	O95427	931 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	EML2	O95834	649 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACSL1	P33121	698 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF75D	P51815	510 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	THOP1	P52888	689 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDX1	P52945	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms