RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552268.5

APAF1-211, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 1,143 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1-211ENST00000552268 COX14Q96I36 57 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SERAC1Q96JX3 654 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 C20orf173Q96LM9 149 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TBATAQ96M53 351 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 IL22Q9GZX6 179 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CDH19Q9H159 772 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 BFARQ9NZS9 450 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.51□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ADAMTS20P59510 1910 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 A0A1B0GTW7 788 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 HEATR9A2RTY3 570 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TMEM202A6NGA9 273 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 C2orf81A6NN90 581 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MEI4A8MW99 385 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TLR4O00206 839 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PRRG2O14669 202 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FPGTO14772 594 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A9O60656 530 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 C1QAP02745 245 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PRSS56P0CW18 603 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A6P19224 532 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A1P22309 533 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A4P22310 534 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 NFKBIAP25963 317 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CD38P28907 300 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 AKT2P31751 481 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 HOXD12P35452 270 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A3P35503 534 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A5P35504 534 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PLTPP55058 493 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 NXPH1P58417 271 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 YPEL5P62699 121 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 IRX4P78413 519 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TMPRSS15P98073 1019 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 OVGP1Q12889 678 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FZD2Q14332 565 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SEMA3AQ14563 771 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 STAT4Q14765 748 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CHRNA6Q15825 494 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 KIF19Q2TAC6 998 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 BICRALQ6AI39 1079 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CES3Q6UWW8 571 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 LAYNQ6UX15 382 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 IQCHQ86VS3 1027 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 DCLK2Q8N568 766 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PAF1Q8N7H5 531 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ZNF398Q8TD17 642 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 STYXQ8WUJ0 223 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PIGKQ92643 395 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 HDAC10Q969S8 669 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 VPS35Q96QK1 796 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MYOCQ99972 504 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 APOOQ9BUR5 198 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 RAB17Q9H0T7 212 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 OR1A2Q9Y585 309 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms