RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 OR8K5Q8NH50 307 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 LRFN5Q96NI6 719 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 OLFM3Q96PB7 478 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-227ENST00000551441 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 MGAT4DA6NG13 374 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 BTN3A3O00478 584 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ZNF749O43361 778 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 KRT1P04264 644 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CBSLP0DN79 551 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CBSP35520 551 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 RRADP55042 308 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 RAB43Q86YS6 212 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 PHC3Q8NDX5 983 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 IPMKQ8NFU5 416 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 TEKT5Q96M29 485 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 XKR8Q9H6D3 395 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 FAM153AQ9UHL3 310 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 POMT2Q9UKY4 750 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 BTN3A1O00481 513 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CTSBP07858 339 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 FIGNQ5HY92 759 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 MRGPREQ86SM8 312 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 TTC13Q8NBP0 860 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 OR2L2Q8NH16 312 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ZNF398Q8TD17 642 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 LCN9Q8WX39 176 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 NENFQ9UMX5 172 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 PKP3Q9Y446 797 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ARL5AQ9Y689 179 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 SEC16AO15027 2179 aa15.63■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 C9J4A7 227 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 E7EQ34 232 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ALOX12BO75342 701 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 H2AFZP0C0S5 128 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 PRF1P14222 555 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 VARSP26640 1264 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ZBED6P86452 979 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 WASHC5Q12768 1159 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 PRKG2Q13237 762 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 OLIG2Q13516 323 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ITGA9Q13797 1035 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 KAZNQ674X7 775 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 H2AFVQ71UI9 128 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CUZD1Q86UP6 607 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 TRIM73Q86UV7 250 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 GALNT16Q8N428 558 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 HAUS1Q96CS2 278 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.62■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PQJ5 194 aa15.61■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 CCDC66A2RUB6 948 aa15.61■□□□□ 0.09
CS-227ENST00000551441 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms