RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 FZD1Q9UP38 647 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 H0YJX3 145 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TNFRSF11BO00300 401 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 STX16O14662 325 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 C5orf34Q96MH7 638 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DERL2Q9GZP9 239 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ACTL8Q9H568 366 aa8.37□□□□□ -1.07
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