RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TAPBPO15533 448 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SGTAO43765 313 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ESRRBO95718 433 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MLYCDO95822 493 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 EGFP01133 1207 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CAPN1P07384 714 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 COX4I1P13073 169 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HGFP14210 728 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NUDT2P50583 147 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DCDC1P59894 354 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MTSS1LQ765P7 747 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FLCNQ8NFG4 579 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KCNK12Q9HB15 430 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OPTCQ9UBM4 332 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OR1A2Q9Y585 309 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MYO10Q9HD67 2058 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CLGNO14967 610 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ATG13O75143 517 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CHEK2O96017 543 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SOD1P00441 154 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FTH1P02794 183 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ANXA5P08758 320 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ITPKAP23677 461 aa8.25□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CCNG1P51959 295 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 STARD3Q14849 445 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RPS6KA2Q15349 733 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 AGKQ53H12 422 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SDE2Q6IQ49 451 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GK5Q6ZS86 529 aa8.25□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 C1orf50Q9BV19 199 aa8.25□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SMOXQ9NWM0 555 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OARD1Q9Y530 152 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 H0Y858 1186 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KLK8O60259 260 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 STK16O75716 305 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PDE5AO76074 875 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HOXB2P14652 356 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HK2P52789 917 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TAS2R38P59533 333 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBCCQ15814 346 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CCSMST1Q4G0I0 132 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PAOXQ6QHF9 649 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LAYNQ6UX15 382 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HIPK4Q8NE63 616 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ASB2Q96Q27 587 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RAD18Q9NS91 495 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CD207Q9UJ71 328 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.25□□□□□ -1.09
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