RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM209Q96SK2 561 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SEPHS2Q99611 448 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 HAT1O14929 419 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 NRP2O60462 931 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 RRM2P31350 389 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF132P52740 706 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 NAB1Q13506 487 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 RNF157Q96PX1 679 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CPXM1Q96SM3 734 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SYBUQ9NX95 663 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SNTNA6NMZ2 147 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ARPC2O15144 300 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 HCRTO43612 131 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6AP2O75787 350 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GP5P40197 560 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SULT1E1P49888 294 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 INPP5AQ14642 412 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 DUSP7Q16829 419 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MON1AQ86VX9 555 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 RMDN1Q96DB5 314 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEB5Q9BZ81 275 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SIK2Q9H0K1 926 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 AGRPO00253 132 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 RBP1P09455 135 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEA12P43365 314 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MAP2K4P45985 399 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 STK11Q15831 433 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3R3Q92569 461 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 EDEM1Q92611 657 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 NXNL1Q96CM4 212 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TOR3AQ9H497 397 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 USP22Q9UPT9 525 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PDE10AQ9Y233 779 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM77I1YAP6 450 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLC2A3P11169 496 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GFAPP14136 432 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 M6PRP20645 277 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PTGS2P35354 604 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PIGAP37287 484 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEA11P43364 429 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLC11A2P49281 568 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 HK2P52789 917 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 OR2B6P58173 313 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GBE1Q04446 702 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 INCA1Q0VD86 236 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CNSTQ6PJW8 725 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PCDH19Q8TAB3 1148 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FAR1Q8WVX9 515 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLC30A3Q99726 388 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 DDIT4Q9NX09 232 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GMIPQ9P107 970 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ISPDA4D126 451 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 EVPLLA8MZ36 301 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 XPNPEP2O43895 674 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 B4GALT3O60512 393 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 C7P10643 843 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TRNP1Q6NT89 227 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL6Q8N531 539 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms