RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa29.37■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 C5orf60A6NFR6 353 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ARGFXA6NJG6 315 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 MATN2O00339 956 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 SLC35G4P0C7Q5 338 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 NDUFS1P28331 727 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 PTGIRP43119 386 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 PRLHRP49683 370 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 RCOR2Q8IZ40 523 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 NAT14Q8WUY8 206 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 PITPNM3Q9BZ71 974 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ASB8Q9H765 288 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 RSPH14Q9UHP6 348 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 TCFL5Q9UL49 500 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 C2orf81A6NN90 581 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 CBFA2T2O43439 604 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 CCL11P51671 97 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ARMC6Q6NXE6 501 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 BBS12Q6ZW61 710 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 EFCAB3Q8N7B9 438 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ACVR1CQ8NER5 493 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 HM13Q8TCT9 377 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 PCMTD2Q9NV79 361 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 FKBPLQ9UIM3 349 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 PCSK5Q92824 1860 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 FER1L5A0AVI2 2057 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ANXA9O76027 345 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 GEMP55040 296 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 FAM198BQ6UWH4 519 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 DAAM2Q86T65 1068 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 HPS6Q86YV9 775 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 OR4E2Q8NGC2 313 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 HAUS1Q96CS2 278 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 TLR10Q9BXR5 811 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 GOLPH3Q9H4A6 298 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 APOC2P02655 101 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 RBL1P28749 1068 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 MARCKSL1P49006 195 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 FHL5Q5TD97 284 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 CFAP206Q8IYR0 622 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 Q8NA96 180 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 GLIS1Q8NBF1 620 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 OR1L3Q8NH93 324 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 FICDQ9BVA6 458 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 FANCEQ9HB96 536 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 SOHLH2Q9NX45 425 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 SNX7Q9UNH6 387 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-202ENST00000505490 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM63AO94886 807 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 PRKAA1Q13131 559 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 C4orf17Q53FE4 359 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 NXPE1Q8N323 547 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 OR52A5Q9H2C5 316 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 LCA5LO95447 670 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 POLBP06746 335 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 CDH3P22223 829 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 ITGA1P56199 1179 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB2Q8N680 514 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 FDCSPQ8NFU4 85 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 HEXDCQ8WVB3 486 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 ULK4Q96C45 1275 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 BTN3A3O00478 584 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 TPM1P09493 284 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 ST6GAL1P15907 406 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 VAV2P52735 878 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 OLIG2Q13516 323 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 DENND5AQ6IQ26 1287 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 MED25Q71SY5 747 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 SYTL1Q8IYJ3 562 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 OR13C4Q8NGS5 318 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 NUDT9Q9BW91 350 aa29.3■■■□□ 2.28
ALYREF-202ENST00000505490 C10orf88Q9H8K7 445 aa29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms