RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF487	B1APH4	448 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	NR2F1	P10589	423 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF45	Q02386	682 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PIGF	Q07326	219 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	USP30	Q70CQ3	517 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	COPS8	Q99627	209 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	VPS51	Q9UID3	782 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CXCL11	O14625	94 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KLHL18	O94889	574 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CHRNA1	P02708	482 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ANXA8	P13928	327 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CTPS1	P17812	591 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TSPAN1	O60635	241 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	IFNW1	P05000	195 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PRG2	P13727	222 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	STEAP4	Q687X5	459 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF597	Q96LX8	424 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PCSK2	P16519	638 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PSEN2	P49810	448 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	E2F2	Q14209	437 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PARP15	Q460N3	678 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KPNA5	O15131	536 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PBX3	P40426	434 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	DIO3	P55073	304 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LGALS12	Q96DT0	336 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MYH11	P35749	1972 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KERA	O60938	352 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	RFPL2	O75678	378 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CD72	P21854	359 aa		13.93	□□□□□ -0.18

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