RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 IQCF5A8MTL0 148 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SDC3O75056 442 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 FAM155BO75949 473 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLCO2B1O94956 709 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 C8GP07360 202 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 COL6A2P12110 1019 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CYP2A7P20853 494 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 POT1Q9NUX5 634 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 A0A096LPK6 155 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 B4DGG1 531 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ATP8B1O43520 1251 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 HIST1H2ADP20671 130 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CDKN2DP55273 166 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 KLF15Q9UIH9 416 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 ZNF839A8K0R7 811 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLC16A5O15375 505 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 ZBTB14O43829 449 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 FUCA1P04066 466 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 CCT5P48643 541 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-213ENST00000493945 PGM2Q96G03 612 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 OLFM1Q99784 485 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 DERL2Q9GZP9 239 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 WWP1Q9H0M0 922 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.59□□□□□ -0.07
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