RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 KIAA1328Q86T90 577 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM129CQ86XR2 697 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.17□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 RSC1A1Q92681 617 aa7.17□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 AMFRQ9UKV5 643 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 RNF112Q9ULX5 631 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.17□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 C5orf60A6NFR6 353 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 MTSS1O43312 755 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 LDB2O43679 373 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 DUX1O43812 170 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 RAD1O60671 282 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 UBXN7O94888 489 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 POLBP06746 335 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 IDSP22304 550 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 F8A1P23610 371 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 GRIA1P42261 906 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 UCNP55089 124 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 SPATA13Q96N96 652 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 TRABDQ9H4I3 376 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 STARD5Q9NSY2 213 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 IL17BQ9UHF5 180 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SPTBP11277 2137 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 OR51F1A6NGY5 319 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 LILRA5A6NI73 299 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ANXA9O76027 345 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TJP3O95049 919 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TIAF1O95411 115 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CSRP3P50461 194 aa7.15□□□□□ -1.26
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