RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa3.1□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 A0A1B0GVY2 172 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TRBC2A0A5B9 178 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TMEM221A6NGB7 291 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 BMP10O95393 424 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TPOP07202 933 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 DGKAP23743 735 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 MARK3P27448 753 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CCR3P51677 355 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ARSEP51690 589 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 THOP1P52888 689 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ERVFC1-1P60608 527 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SIRPAP78324 504 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SNAPC1Q16533 368 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GRTP1Q5TC63 336 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ARMC3Q5W041 872 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TMTC2Q8N394 836 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 POC1AQ8NBT0 407 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CCDC34Q96HJ3 373 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 HHATLQ9HCP6 504 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 Q9N2K0 584 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 DONSONQ9NYP3 566 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 RNF150Q9ULK6 438 aa3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 A0A0G2JNG1 304 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 ANKUB1A6NFN9 424 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 H0YIN7 160 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 SSX4O60224 188 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TFAP2AP05549 437 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 VPREB1P12018 145 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 MCCP23508 829 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 MPZP25189 248 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 AHRP35869 848 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 PSMC4P43686 418 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 ARL16Q0P5N6 197 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 ALCAMQ13740 583 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 KIR2DS5Q14953 304 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 CBWD6Q4V339 395 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 CBWD3Q5JTY5 395 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 C1orf141Q5JVX7 400 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 GCNT6Q5T4J0 391 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 KRT74Q7RTS7 529 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 NAGSQ8N159 534 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 DNAAF4Q8WXU2 420 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 VPS33AQ96AX1 596 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 C17orf77Q96MU5 243 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 NEURL2Q9BR09 285 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 OR10A4Q9H209 315 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 EQTNQ9NQ60 294 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 YIPF1Q9Y548 306 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TSPY2A6NKD2 308 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TRIM77I1YAP6 450 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 GPR137BO60478 399 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 CTSVO60911 334 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 CELF2O95319 508 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 BAG4O95429 457 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TSPY3P0CV98 308 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TSPY8P0CW00 308 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 PTPN3P26045 913 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 CAPZA2P47755 286 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TAF6P49848 677 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 CDK3Q00526 305 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TSPY1Q01534 308 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 DMPKQ09013 629 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 GAGE2BQ13066 116 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 PLA2G7Q13093 441 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 CAMK2DQ13557 499 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 GAGE2EQ4V326 116 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms