RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 CTGFP29279 349 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PSMD8P48556 350 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 EFEMP1Q12805 493 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CEP78Q5JTW2 689 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NTAN1Q96AB6 310 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GPR78Q96P69 363 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RERGLQ9H628 205 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UTS2RQ9UKP6 389 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087X1B8 175 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8CPA6NN73 597 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 C1RP00736 705 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 HTR1AP08908 422 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRCAPQ14761 206 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD4AQ8N468 514 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf18Q9UK00 162 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SARDHQ9UL12 918 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ICMTO60725 284 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UPK1BO75841 260 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CRYZL1O95825 349 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ALPLP05186 524 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ASGR1P07306 291 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ELNP15502 786 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf74Q86VG3 221 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A9Q8IVM8 553 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP10Q96AY3 582 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZIC5Q96T25 663 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TARM1B6A8C7 271 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 M0QX08 132 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NCAM2O15394 837 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SSX4O60224 188 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MT-ND2P03891 347 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ANXA6P08133 673 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CXCR2P25025 360 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LIMS2Q7Z4I7 341 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SVOPQ8N4V2 548 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ISL2Q96A47 359 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC9A7Q96T83 725 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 EHD3Q9NZN3 535 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A3O75751 556 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MED26O95402 600 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PBX3P40426 434 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXN2Q5MJ10 180 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD11Q693B1 232 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 EID3Q8N140 333 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 OR10A6Q8NH74 314 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MUL1Q969V5 352 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ERVK13-1Q9NX77 482 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FAM50BQ9Y247 325 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 J3KR12 359 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GPR182O15218 404 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 AIREO43918 545 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CDK14O94921 469 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DIRAS1O95057 198 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF682O95780 498 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CYBBP04839 570 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CCR1P32246 355 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CRHR2Q13324 411 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RAPSNQ13702 412 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ACAP2Q15057 778 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DET1Q7L5Y6 550 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ACTR8Q9H981 624 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 POLG2Q9UHN1 485 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SNX6Q9UNH7 406 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 VWA7Q9Y334 891 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms