RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPIP06744 558 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRDX6P30041 224 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPN5P54829 565 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB6Q15916 424 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRF1Q5T601 910 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFNL1Q8IU54 200 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KBTBD8Q8NFY9 601 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q96MT0 163 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB26Q9ULW5 256 aa16.35■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGAXP20702 1163 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCNN1AP37088 669 aa16.35■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERVK_113P63132 956 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRE1Q14246 886 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRB14Q14449 540 aa16.35■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ART5Q96L15 291 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.35■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.35■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCA3Q99758 1704 aa16.35■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNE1P15382 129 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC9A6Q92581 669 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF132P52740 706 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G16P53816 162 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.34■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ROPN1LQ96C74 230 aa16.34■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMA3P25788 255 aa16.34■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OMA1Q96E52 524 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEPHQ9BQS7 1158 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGBP02675 491 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK12P53778 367 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDH12P55289 794 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ECT2LQ008S8 904 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM180AQ6UWF9 173 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX47Q8TBZ9 253 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FANCEQ9HB96 536 aa16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABLIM1O14639 778 aa16.33■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCCBP05166 539 aa16.33■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.33■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.33■□□□□ 0.21
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