RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 VCLP18206 1134 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 ARFIP2P53365 341 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 IFT88Q13099 833 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 PRKAA1Q13131 559 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 SETDB1Q15047 1291 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 C6orf89Q6UWU4 347 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 NEK10Q6ZWH5 1172 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 MAVSQ7Z434 540 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 GLMNQ92990 594 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 SLC12A9Q9BXP2 914 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 GFYI3L273 518 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 HGSO14964 777 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 PXNP49023 591 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 RPIAP49247 311 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 RPL14P50914 215 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 ARHGAP8P85298 464 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 NFE2L1Q14494 772 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 PJA1Q8NG27 643 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 OR2L2Q8NH16 312 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 CFAP61Q8NHU2 1237 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 COG4Q9H9E3 785 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 RDH14Q9HBH5 336 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 HAO1Q9UJM8 370 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 TMCO1Q9UM00 188 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 USH1CQ9Y6N9 552 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 H0Y8X5 98 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF195O14628 629 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 GRID2O43424 1007 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 MATN4O95460 622 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 C8GP07360 202 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 ANKS6Q68DC2 871 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 SLC22A15Q8IZD6 547 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 PDPRQ8NCN5 879 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 EGFL8Q99944 293 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 PARVBQ9HBI1 364 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 KRT87PA6NCN2 255 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 MGAT4DA6NG13 374 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 C10orf142B7Z368 130 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 TAPBPO15533 448 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 S100BP04271 92 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 FAM219BQ5XKK7 198 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 LRRTM4Q86VH4 590 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 CLDN23Q96B33 292 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 BMFQ96LC9 184 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 EBF4Q9BQW3 602 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 KCNK4Q9NYG8 393 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM233B4DJY2 109 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 LATO43561 262 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 CEACAM5P06731 702 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 RPS17P08708 135 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 CUZD1Q86UP6 607 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 TRPC4APQ8TEL6 797 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 RHBDF1Q96CC6 855 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 GPR174Q9BXC1 333 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 CHRDQ9H2X0 955 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 H3BM21 787 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 IGHV4-34P06331 123 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 DCNP07585 359 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 CLCQ05315 142 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 MTAPQ13126 283 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 SH2D4BQ5SQS7 431 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 AMZ2Q86W34 360 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 RASGRP3Q8IV61 690 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 GJD3Q8N144 294 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 TRMOQ9BU70 441 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 ZBTB26Q9HCK0 441 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 ARL15Q9NXU5 204 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 PCTPQ9UKL6 214 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-207ENST00000472863 E2F3O00716 465 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 FPGTO14772 594 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 FSBPO95073 299 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 SH3BP2P78314 561 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 DENND6BQ8NEG7 585 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 ABCF3Q9NUQ8 709 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 SLC16A5O15375 505 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 CD6P30203 668 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 HSPA7P48741 367 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-207ENST00000472863 SULT1C3Q6IMI6 304 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms