RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 PCTPQ9UKL6 214 aa13.32□□□□□ -0.28
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SH3BP1-206ENST00000469947 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 IRAK2O43187 625 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
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SH3BP1-206ENST00000469947 ERVPABLB-1P60509 514 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPY1Q01534 308 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-206ENST00000469947 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
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SH3BP1-206ENST00000469947 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
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