RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 SSX5O60225 188 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PCDHGA12O60330 932 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SRGAP2O75044 1071 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SNAPINO95295 136 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 WISP1O95388 367 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 IGLV3-19P01714 112 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ASLP04424 464 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 GLAP06280 429 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CLUP10909 449 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RHCEP18577 417 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 GSTT1P30711 240 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PHBP35232 272 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CTSKP43235 329 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CXCR3P49682 368 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ALDH3A2P51648 485 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF4P78317 190 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 HPCAP84074 193 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RHDQ02161 417 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 XRCC4Q13426 336 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RTP5Q14D33 572 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TEAD4Q15561 434 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 MPPE1Q53F39 396 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 MPP7Q5T2T1 576 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 LYPD8Q6UX82 237 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ASPGQ86U10 573 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CHSY1Q86X52 802 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 EMC1Q8N766 993 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PPM1NQ8N819 430 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 INPP5DQ92835 1189 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 FGF11Q92914 225 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 IGSF8Q969P0 613 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB7BQ96AH8 199 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 BIRC7Q96CA5 298 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 LMLNQ96KR4 655 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM237Q96Q45 408 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PSD2Q9BQI7 771 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PINK1Q9BXM7 581 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ABCG8Q9H221 673 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SP140LQ9H930 580 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF112Q9ULX5 631 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 NENFQ9UMX5 172 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CAPN8A6NHC0 703 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 E7EVH7 732 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNN4O15554 427 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TBL1XO60907 577 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 MFAP3LO75121 409 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PAGE1O75459 146 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJB5O75953 348 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SASH3O75995 380 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ENDOD1O94919 500 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CRTAMO95727 393 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PLATP00750 562 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PDGFAP04085 211 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CYBBP04839 570 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SERPING1P05155 500 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 IL6P05231 212 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 POLBP06746 335 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ANXA6P08133 673 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ITGA2BP08514 1039 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 QDPRP09417 244 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC2A3P11169 496 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ACADMP11310 421 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TACR2P21452 398 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 HLA-FP30511 346 aa7.22□□□□□ -1.25
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