RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	CD320	Q9NPF0	282 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP10	Q9P2G4	905 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TIMM22	Q9Y584	194 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPAN11	A1L157	253 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NME4	O00746	187 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PRMT3	O60678	531 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FGB	P02675	491 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CD70	P32970	193 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RPIA	P49247	311 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HK3	P52790	923 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ST8SIA6	P61647	398 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAF3	Q13114	568 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FXN	Q16595	210 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ERAP2	Q6P179	960 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FOPNL	Q96NB1	174 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNA7	Q96RP8	456 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	APOL5	Q9BWW9	433 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DPY30	Q9C005	99 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	BRD9	Q9H8M2	597 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf109	Q9NX04	203 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758		K7ERQ8	282 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	OR7A17	O14581	309 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PER2	O15055	1255 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CLPTM1	O96005	669 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FES	P07332	822 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LINGO3	P0C6S8	592 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HSD3B1	P14060	373 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CSF2RA	P15509	400 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HSD3B2	P26439	372 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	AOAH	P28039	575 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPA7	P48741	367 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ERF	P50548	548 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CREB5	Q02930	508 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ABR	Q12979	859 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	GBX1	Q14549	363 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LIPJ	Q5W064	366 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.29	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms