RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 LMLNQ96KR4 655 aa13.45□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 CORO1BQ9BR76 489 aa13.45□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.45□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 SPATA16Q9BXB7 569 aa13.45□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 SLC2A11Q9BYW1 496 aa13.45□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 ELOVL2Q9NXB9 296 aa13.45□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 PADI4Q9UM07 663 aa13.45□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 MAP3K13O43283 966 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 POP4O95707 220 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 CLPTM1O96005 669 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 TIMP1P01033 207 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 ANXA5P08758 320 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 OR56A5P0C7T3 313 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 EBLN1P0CF75 366 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 EPB42P16452 691 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 HTR1EP28566 365 aa13.44□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 PHKG1Q16816 387 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 FUT11Q495W5 492 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 CARD16Q5EG05 197 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 RABL3Q5HYI8 236 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 PPP4R4Q6NUP7 873 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 LILRA6Q6PI73 481 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 HID1Q8IV36 788 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 CMTM8Q8IZV2 173 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.44□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 NTMT1Q9BV86 223 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 SLC29A3Q9BZD2 475 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa13.44□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.44□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 IL12AP29459 219 aa13.43□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 SLC46A2Q9BY10 475 aa13.43□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 NANOGQ9H9S0 305 aa13.43□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.43□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 LZTS1Q9Y250 596 aa13.43□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 C7P10643 843 aa13.43□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 PKD2L2Q9NZM6 624 aa13.43□□□□□ -0.26
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THBS3-202ENST00000428962 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.43□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa13.42□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 C7orf72A4D263 438 aa13.42□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 KRT6AP02538 564 aa13.42□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 KRT6BP04259 564 aa13.42□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 SLC2A4P14672 509 aa13.42□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 PCSK2P16519 638 aa13.42□□□□□ -0.26
THBS3-202ENST00000428962 NFKBIAP25963 317 aa13.42□□□□□ -0.26
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