RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 NCK1P16333 377 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PERM1Q5SV97 790 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PLGRKTQ9HBL7 147 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PIRO00625 290 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNGP01579 166 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35G6P0C7Q6 338 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 DDI2Q5TDH0 399 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2U1Q7Z449 544 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC11A1P49279 550 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC18A1P54219 525 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GDPD4Q6W3E5 623 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PCBD2Q9H0N5 130 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC26A3P40879 764 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PQLC3Q8N755 202 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPN18Q99952 460 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CMTM6Q9NX76 183 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXW2Q9UKT8 454 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 WNT9AO14904 365 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PEX2P28328 305 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 OLR1P78380 273 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM198Q66K66 360 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MBLAC2Q68D91 279 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PEBP4Q96S96 227 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ABLIM1O14639 778 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 TMCC2O75069 709 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 GJA1P17302 382 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MYL9P24844 172 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 IL12RB1P42701 662 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVK-8P63133 956 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52J3Q8NH60 311 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF563Q8TA94 476 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SESN1Q9Y6P5 492 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 A8MT66 165 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ITM2AO43736 263 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 AHSGP02765 367 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH3P22223 829 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 HSPB3Q12988 150 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DNASE1L2Q92874 299 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 RCVRNP35243 200 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 AMZ2Q86W34 360 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 POC5Q8NA72 575 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DPEP2Q9H4A9 486 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SCAMP1O15126 338 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 AOC2O75106 756 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 STAT5AP42229 794 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ARMC3Q5W041 872 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NAPRTQ6XQN6 538 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 INSL6Q9Y581 213 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FADS2P1A8MWK0 482 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NADKO95544 446 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM27Q9HBJ8 222 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM234BA2RU67 622 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ARSIQ5FYB1 569 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM129CQ86XR2 697 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 S100ZQ8WXG8 99 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 IRGMA1A4Y4 181 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MCIDASD6RGH6 385 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 H0YC42 278 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CXCR6O00574 342 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 TP73O15350 636 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ECI2O75521 394 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms