RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 WASH4PA8MWX3 477 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 TOR1BO14657 336 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SEC14L5O43304 696 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PROM1O43490 865 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 B4GAT1O43505 415 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 HS6ST1O60243 411 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 XYLBO75191 536 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GRAP2O75791 330 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CDK14O94921 469 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ARHGEF15O94989 841 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 EPN2O95208 641 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ZBTB7AO95365 584 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MAP3K6O95382 1288 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 IL7RP16871 459 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ERCC2P18074 760 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 KCNA5P22460 613 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 IGFBP5P24593 272 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 YWHAQP27348 245 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 KRT20P35900 424 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DCTP40126 519 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PIK3CBP42338 1070 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CCR10P46092 362 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SUOXP51687 545 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MAPK10P53779 464 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 AGERQ15109 404 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 UNC50Q53HI1 259 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ISCA2Q86U28 154 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CCDC190Q86UF4 302 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CPXCR1Q8N123 301 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PGBD3Q8N328 593 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RNF149Q8NC42 400 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FIG4Q92562 907 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 WDFY2Q96P53 400 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RAD9AQ99638 391 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 IL12RB2Q99665 862 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 BTBD2Q9BX70 525 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RNF146Q9NTX7 359 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ING3Q9NXR8 418 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DPP3Q9NY33 737 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 IL37Q9NZH6 218 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SNX7Q9UNH6 387 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RNF6Q9Y252 685 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ITM2BQ9Y287 266 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PARP14Q460N5 1801 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 E2F8A0AVK6 867 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CCDC182A6NF36 153 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 A8MVJ9 347 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 LACTBL1A8MY62 500 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PIP5K1BO14986 540 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MUSKO15146 869 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 KCNQ2O43526 872 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MPZL2O60487 215 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FAM20BO75063 409 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SEC22BO75396 215 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 VPS26AO75436 327 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FTH1P02794 183 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ALPPP05187 535 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 IL6P05231 212 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 STAG3L1P0CL83 205 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 HDCP19113 662 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CYP2A7P20853 494 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CD9P21926 228 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CPN2P22792 545 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CES1P23141 567 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CHRNA5P30532 468 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ADRA1BP35368 520 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 AVPR1AP37288 418 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MAGEA2P43356 314 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms