RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.05■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PQU0 124 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 MYO1CO00159 1063 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 AZIN1O14977 448 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 KPNA5O15131 536 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 FSBPO95073 299 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 FGF4P08620 206 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 MPC1LP0DKB6 136 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 KCNJ2P63252 427 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TFF2Q03403 129 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 KRT72Q14CN4 511 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 XKR5Q6UX68 686 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ASRGL1Q7L266 308 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 COX14Q96I36 57 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 GUCD1Q96NT3 240 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TMCO1Q9UM00 188 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 OR1A2Q9Y585 309 aa15.04■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 GFYI3L273 518 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 DCXO43602 365 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ATP6AP2O75787 350 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 FOSL2P15408 326 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ADPRHP54922 357 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TDGQ13569 410 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 GTF2H2Q13888 395 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 IRF4Q15306 451 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TEX9Q8N6V9 391 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM159Q96B96 161 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ASB2Q96Q27 587 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 RDH14Q9HBH5 336 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PARVBQ9HBI1 364 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 FZD3Q9NPG1 666 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ARL15Q9NXU5 204 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 OR7A17O14581 309 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 KATNA1O75449 491 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 POP7O75817 140 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 OR4F21O95013 312 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SRFP11831 508 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFV2P19404 249 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CDK3Q00526 305 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SYTL3Q4VX76 610 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 FAM91A1Q658Y4 838 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SULT1C3Q6IMI6 304 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 RINLQ6ZS11 566 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 Q6ZS52 159 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ACAD11Q709F0 780 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 POU5F2Q8N7G0 328 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 OR56A4Q8NGH8 313 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO27Q8NI29 283 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL29Q96CT2 875 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 FAR2Q96K12 515 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CATSPER2Q96P56 530 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 MYOCQ99972 504 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CD244Q9BZW8 370 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms