RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TK2O00142 265 aa26.87■■□□□ 1.89
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ETV4P43268 484 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUBP1P53384 320 aa26.87■■□□□ 1.89
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H2ADP20671 130 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLCNKAP51800 687 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDZD3Q86UT5 571 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM151AQ8N4L1 468 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCOLN3Q8TDD5 553 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC126Q96EE4 140 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa26.82■■□□□ 1.88
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