RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 MAXP61244 160 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 GRIK2Q13002 908 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 C14orf80Q86SX3 495 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 UGT2B28Q9BY64 529 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 AASSQ9UDR5 926 aa18.5■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 AREL1O15033 823 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 GRIK1P39086 918 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 IHHQ14623 411 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 KDELC1Q6UW63 502 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PROX1Q92786 737 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PAGE1O75459 146 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 GJB3O75712 270 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 B3GAT3O94766 335 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 GOT2P00505 430 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 OR4Q2P0C623 313 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 BMP1P13497 986 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 LCP2Q13094 533 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 DLEU7Q6UYE1 221 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 FBLIM1Q8WUP2 373 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SLC47A1Q96FL8 570 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ANKHQ9HCJ1 492 aa18.49■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 FAM234BA2RU67 622 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SCO2O43819 266 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 NPPAP01160 153 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 FTH1P02794 183 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 LHX1P48742 406 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SLC35A2P78381 396 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ITM2CQ9NQX7 267 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 OPTCQ9UBM4 332 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 AGAP5A6NIR3 686 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TAF4O00268 1085 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 MT-ND2P03891 347 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ITKQ08881 620 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PTPRCAPQ14761 206 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF404Q494X3 552 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PROKR1Q8TCW9 393 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 CHAC2Q8WUX2 184 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 NUDT8Q8WV74 236 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 DCSTAMPQ9H295 470 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ACTR8Q9H981 624 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 LIMD1Q9UGP4 676 aa18.48■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 EFCAB9A8MZ26 197 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 H0Y626 953 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 SLC16A6O15403 523 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PRKD3O94806 890 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TRIM16O95361 564 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 UPP1Q16831 310 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TTC23LQ6PF05 361 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 NECAB2Q7Z6G3 386 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ZFAND4Q86XD8 727 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 EID3Q8N140 333 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 OR2T11Q8NH01 316 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 DUSP21Q9H596 190 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF221Q9UK13 617 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 CYP11A1P05108 521 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 FDXRP22570 491 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 DCTP40126 519 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 CD86P42081 329 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PLIN5Q00G26 463 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TSPY1Q01534 308 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 IL18R1Q13478 541 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 LAIR1Q6GTX8 287 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 TUBA3EQ6PEY2 450 aa18.47■□□□□ 0.55
CNOT11-201ENST00000289382 DPP10Q8N608 796 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms