RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PEBP4Q96S96 227 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL4Q9UKA2 621 aa15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DAPK3O43293 454 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 MTX2O75431 263 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CBSLP0DN79 551 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 FERP16591 822 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CBSP35520 551 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SMSP52788 366 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 GLYATL1Q969I3 302 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PTERQ96BW5 349 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 FOXC2Q99958 501 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM121Q9BTD3 319 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TSPY26PQ9H489 355 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CHKBQ9Y259 395 aa15.91■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC66A2RUB6 948 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD62A6NC57 917 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 E7EQ34 232 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 HBQ1P09105 142 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 MST1P26927 711 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PREPP48147 710 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 IST1P53990 364 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R2AP63151 447 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 MAMLD1Q13495 774 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 OR1N1Q8NGS0 311 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 EID2BQ96D98 161 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM7Q9C029 511 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 NT5MQ9NPB1 228 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 POMT2Q9UKY4 750 aa15.9■□□□□ 0.14
SPCS1-201ENST00000233025 OR6C74A6NCV1 312 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 DCDC1P59894 354 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 LTBQ06643 244 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 MFAP5Q13361 173 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 MARC1Q5VT66 337 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ALS2CLQ60I27 953 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 GPR26Q8NDV2 337 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 NUP85Q9BW27 656 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 LHPPQ9H008 270 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ABI3Q9P2A4 366 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 MYO6Q9UM54 1294 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 CDYLQ9Y232 598 aa15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 H3BMH7 237 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 CDK14O94921 469 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 CD63P08962 238 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 FOSL1P15407 271 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 VCLP18206 1134 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 CDH3P22223 829 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 PSMA2P25787 234 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 LMAN1P49257 510 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 CDH6P55285 790 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 TYRO3Q06418 890 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 DMPKQ09013 629 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 GALNT3Q14435 633 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 C3AR1Q16581 482 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 LONRF1Q17RB8 773 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ARMC6Q6NXE6 501 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms