RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

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Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 BOLA3Q53S33 107 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 LCN10Q6JVE6 187 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 GPR26Q8NDV2 337 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 OR1L3Q8NH93 324 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 RELTQ969Z4 430 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF653Q96CK0 615 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 POM121Q96HA1 1249 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 CNDP1Q96KN2 507 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 POMT2Q9UKY4 750 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF711Q9Y462 761 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.4□□□□□ -1.06
HLA-B-257ENST00000640094 SPTBP11277 2137 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 GSAPA4D1B5 854 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 OR6C74A6NCV1 312 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 AGPSO00116 658 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 HLA-DQB2P05538 268 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 PYGMP11217 842 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 MX2P20592 715 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CCNCP24863 283 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 HTR1EP28566 365 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CD86P42081 329 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 HIF1AQ16665 826 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 NACC2Q96BF6 587 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 VPS50Q96JG6 964 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 C12orf66Q96MD2 445 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 AGAP4Q96P64 663 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 DTLQ9NZJ0 730 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.39□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CACNA1CQ13936 2221 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC66A2RUB6 948 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 KCNN4O15554 427 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF749O43361 778 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 JRKO75564 520 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 LCA5LO95447 670 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 MYBL1P10243 752 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CD1EP15812 388 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 IL1R2P27930 398 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ITGA9Q13797 1035 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 KRT33BQ14525 404 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 KRT31Q15323 416 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 TESK1Q15569 626 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 MLIPQ5VWP3 458 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 HOOK3Q86VS8 718 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 CHTF18Q8WVB6 975 aa8.38□□□□□ -1.07
HLA-B-257ENST00000640094 PTERQ96BW5 349 aa8.38□□□□□ -1.07
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