RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 BOCQ9BWV1 1114 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITM2BQ9Y287 266 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SUPT7LO94864 414 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 KITP10721 976 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITGB6P18564 788 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SP140Q13342 867 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDKL4Q5MAI5 379 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKS6Q68DC2 871 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC23LQ6PF05 361 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SFTPA1Q8IWL2 248 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR6Y1Q8NGX8 325 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ELMO1Q92556 727 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM159Q96B96 161 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHF21BQ96EK2 531 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM39Q9HCM9 518 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PREBQ9HCU5 417 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCN8AQ9UQD0 1980 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A1W2PP55 124 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR89AB7ZAQ6 455 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC16A5O15375 505 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR39O43194 453 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRCPO75575 148 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 MLYCDO95822 493 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR89BP0CG08 455 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 VCLP18206 1134 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYP2A7P20853 494 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TEAD1P28347 426 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIK3CGP48736 1102 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 RASSF2P50749 326 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 AQP5P55064 265 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGERQ15109 404 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CSRP2Q16527 193 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPDYAQ5MJ70 313 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEL1L3Q68CR1 1132 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACAD11Q709F0 780 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 C10orf82Q8WW14 230 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIC2Q96JB3 615 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 OARD1Q9Y530 152 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 IQCF5A8MTL0 148 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC30A4O14863 429 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK14O94921 469 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHEK2O96017 543 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SBK3P0C264 359 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 GMPRP36959 345 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PGGT1BP53609 377 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBCCQ15814 346 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PFKFB4Q16877 469 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGBL4Q5VU57 503 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CGB2Q6NT52 195 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 DET1Q7L5Y6 550 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 NETO1Q8TDF5 533 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 STON2Q8WXE9 905 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTERQ96BW5 349 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 EGFL8Q99944 293 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 RDH14Q9HBH5 336 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 HCN2Q9UL51 889 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR34Q9UPC5 381 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 MED16Q9Y2X0 877 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms