RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GVG6 124 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC2A4P14672 509 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FASP25445 335 aa11.6□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.6□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRLS1Q9UJA2 301 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ST14Q9Y5Y6 855 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MICAL3Q7RTP6 2002 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.6□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDKN3Q16667 212 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM60Q495X7 471 aa11.6□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COQ5Q5HYK3 327 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CERS6Q6ZMG9 384 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNX20Q7Z614 316 aa11.6□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBFAQ8N0V3 343 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC39A11Q8N1S5 342 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR26Q8NDV2 337 aa11.6□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TFAP2CQ92754 450 aa11.6□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF558Q96NG5 402 aa11.6□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCRBV5S2A0A599 114 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 URODP06132 367 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGALP20701 1170 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HRH2P25021 359 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACRV1P26436 265 aa11.59□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.59□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRIK2Q13002 908 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF7Q14155 803 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOMEZQ8IX15 550 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FIBCD1Q8N539 461 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BIRC7Q96CA5 298 aa11.59□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MPP4Q96JB8 637 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF145Q96MT1 663 aa11.59□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WWOXQ9NZC7 414 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLQ9UEF7 1012 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.59□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H0YJX3 145 aa11.59□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACOX3O15254 700 aa11.59□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCSK6P29122 969 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HTRA3P83110 453 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXM1Q08050 763 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LSAMPQ13449 338 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPRC6AQ5T6X5 926 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DET1Q7L5Y6 550 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HID1Q8IV36 788 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OFCC1Q8IZS5 231 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBTB2Q8N680 514 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPEARQ8WU66 669 aa11.59□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYGBQ8WWM9 190 aa11.59□□□□□ -0.55
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