RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 UGP2Q16851 508 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ODF2Q5BJF6 829 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 KRT39Q6A163 491 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PNCKQ6P2M8 343 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZNF653Q96CK0 615 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 OLFM3Q96PB7 478 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TEX101Q9BY14 249 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PCDH18Q9HCL0 1135 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 EXOC1Q9NV70 894 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TCFL5Q9UL49 500 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SNX10Q9Y5X0 201 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CCDC188H7C350 402 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CCL21O00585 134 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SNX3O60493 162 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RHOBTB3O94955 611 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CLDN14O95500 239 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 HEXAP06865 529 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 GLI1P08151 1106 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 NUDT17P0C025 328 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 FAM153BP0C7A2 387 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 IGFBP2P18065 325 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 MAPK9P45984 424 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SEPHS1P49903 392 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 GUCY2DQ02846 1103 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 UBXN1Q04323 297 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 NFATC2Q13469 925 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TAF5Q15542 800 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PPP2R5EQ16537 467 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 KYNUQ16719 465 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 LONRF1Q17RB8 773 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 FAM153CQ494X1 144 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 FCRL6Q6DN72 434 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 NUDT8Q8WV74 236 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SIK2Q9H0K1 926 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 OLAHQ9NV23 265 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RAB20Q9NX57 234 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 GALNT8Q9NY28 637 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 AIPL1Q9NZN9 384 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 COX16Q9P0S2 106 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SNX7Q9UNH6 387 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.46□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 THAP12O43422 761 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ATP6V1G1O75348 118 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 AGTP01019 485 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CAPN1P07384 714 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ACVRL1P37023 503 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 GPD2P43304 727 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SERPINB8P50452 374 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ADAM8P78325 824 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SLC7A5Q01650 507 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 LCN10Q6JVE6 187 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 GALNT16Q8N428 558 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PAGE5Q96GU1 130 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 OR2M4Q96R27 311 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms