RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GUCA1CO95843 209 aa16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa16.22■□□□□ 0.19
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.22■□□□□ 0.19
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WWOXQ9NZC7 414 aa16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDUFA13Q9P0J0 144 aa16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OPTCQ9UBM4 332 aa16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LZTS1Q9Y250 596 aa16.21■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCRBV5S2A0A599 114 aa16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A8MX80 341 aa16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 K7EPI3 171 aa16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRM6O15303 877 aa16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KATNA1O75449 491 aa16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR47O94967 919 aa16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSF2RAP15509 400 aa16.2■□□□□ 0.18
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