RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558604.1

ACAN-204, Transcript of aggrecan, humanhuman

TSL 2

Gene ACAN, Length 749 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAN-204ENST00000558604 GPR33Q49SQ1 333 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 KCTD11Q693B1 232 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 UBXN4Q92575 508 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 FAM117AQ9C073 453 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 RAB33BQ9H082 229 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 PDE7BQ9NP56 450 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.5□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 OR5K3A6NET4 321 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 KALRNO60229 2985 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 DLGAP3O95886 979 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 PRKAR1AP10644 381 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SFTPCP11686 197 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ACRV1P26436 265 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 NDUFS1P28331 727 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CACNG1Q06432 222 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ABHD18Q0P651 414 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 NFATC3Q12968 1075 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 PRKAA1Q13131 559 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 BORAQ6PGQ7 559 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 XKR5Q6UX68 686 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CCDC89Q8N998 374 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 EXD3Q8N9H8 876 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 STARD8Q92502 1023 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ATMQ13315 3056 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 OR6C74A6NCV1 312 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 TLCD2A6NGC4 264 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 AGAP14A8MT82 685 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 B8ZZF3 427 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ARHGAP6O43182 974 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 LIASO43766 372 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 KIAA0754O94854 1291 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 STAT5AP42229 794 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 MC1RQ01726 317 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CDC20Q12834 499 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CDH17Q12864 832 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 MAP7Q14244 749 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 RPS6KA1Q15418 735 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 STYXQ8WUJ0 223 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CATSPER2Q96P56 530 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CD180Q99467 661 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 MAP3K3Q99759 626 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 COG4Q9H9E3 785 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 RARRES3Q9UL19 164 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.48□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 GSAPA4D1B5 854 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 H7C0S8 307 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SGTAO43765 313 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 SLC28A2O43868 658 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CCDC175P0C221 793 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 PRSS56P0CW18 603 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 FGF5P12034 268 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 ZNF28P17035 718 aa14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACAN-204ENST00000558604 DLSTP36957 453 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms