RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	TEX28	O15482	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	AP2A2	O94973	939 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TSPAN12	O95859	305 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GPI	P06744	558 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	C8G	P07360	202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PDHA1	P08559	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	IL10	P22301	178 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ACRV1	P26436	265 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GABRR2	P28476	465 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	NNMT	P40261	264 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CSK	P41240	450 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ABL2	P42684	1182 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	RGR	P47804	291 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	EMX2	Q04743	252 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKG2	Q13237	762 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SP140	Q13342	867 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	KIF19	Q2TAC6	998 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	XKR7	Q5GH72	579 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	IL23R	Q5VWK5	629 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PROSER1	Q86XN7	944 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	DPP10	Q8N608	796 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	LINGO1	Q96FE5	620 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SERTM1	A2A2V5	107 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CFAP99	D6REC4	459 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442		H3BNX3	289 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF197	O14709	1029 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	RGS14	O43566	566 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TSPAN3	O60637	253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	EED	O75530	441 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC22A3	O75751	556 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GSTM1	P09488	218 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	OR56A5	P0C7T3	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	IRF1	P10914	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HGF	P14210	728 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPN2	P17706	415 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GGT5	P36269	586 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GMPR	P36959	345 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	THOP1	P52888	689 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	AP1S2	P56377	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	DCDC1	P59894	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GSTM4	Q03013	218 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	RCAN2	Q14206	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIP10	Q15642	601 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PIM3	Q86V86	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	NTMT1	Q9BV86	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ASB8	Q9H765	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	PADI4	Q9UM07	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-223	ENST00000550442	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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