RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 ACVRL1P37023 503 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GRIA3P42263 894 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CDKN2BP42772 138 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 UPP1Q16831 310 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MZT2AQ6P582 158 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CLCC1Q96S66 551 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF30P17039 623 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SLC7A1P30825 629 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ARCQ7LC44 396 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SERINC5Q86VE9 423 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF527Q8NB42 609 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ART5Q96L15 291 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UBOX5O94941 541 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PRKCHP24723 683 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ADSSP30520 456 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GRIA2P42262 883 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SCTRP47872 440 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HCAR3P49019 387 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HEPACAMQ14CZ8 416 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FAM13CQ8NE31 585 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HLA-CQ95604 372 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HCN2Q9UL51 889 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TIMM22Q9Y584 194 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PP55 124 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 H3BQF6 201 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 COCHO43405 550 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MFN2O95140 757 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HLA-DQB2P05538 268 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CD247P20963 164 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 AHCYP23526 432 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CHRNA4P43681 627 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ARFIP1P53367 373 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ADRM1Q16186 407 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OTUB2Q96DC9 234 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CALML5Q9NZT1 146 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SHPRHQ149N8 1683 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A9O60656 530 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FAM155BO75949 473 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A6P19224 532 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A1P22309 533 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A4P22310 534 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 AQP1P29972 269 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A3P35503 534 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEA11P43364 429 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PER3P56645 1201 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PSME3P61289 254 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RHAGQ02094 409 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CHRNA6Q15825 494 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CA9Q16790 459 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC66Q68CR7 880 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms