RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RNF149Q8NC42 400 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CLRN3Q8NCR9 226 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR2AK2Q8NG84 335 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR6J1Q8NGC5 347 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR4Q3Q8NH05 313 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR4C3Q8NH37 302 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FBXO30Q8TB52 745 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM71BQ8TC56 605 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KIAA1524Q8TCG1 905 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAPK15Q8TD08 544 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC38A5Q8WUX1 472 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ARHGAP45Q92619 1136 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PHF21AQ96BD5 680 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTERQ96BW5 349 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAF2Q96CS3 445 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C16orf74Q96GX8 76 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CLUHP3Q96NS8 147 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NT5C1BQ96P26 610 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 QRFPRQ96P65 431 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OVOL2Q9BRP0 275 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HAUS8Q9BT25 410 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCDC28BQ9BUN5 200 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IFT27Q9BW83 186 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OCR1Q9BZK8 76 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 COG4Q9H9E3 785 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PCDH12Q9NPG4 1184 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ARL15Q9NXU5 204 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MSRB2Q9Y3D2 182 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PKP3Q9Y446 797 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GPR45Q9Y5Y3 372 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HSPG2P98160 4391 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTPRCP08575 1304 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LAMA5O15230 3695 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DOCK9Q9BZ29 2069 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A1W2PR80 420 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCDC154A6NI56 674 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RHPN2P1A8MT19 583 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRSS46E5RG02 174 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GFYI3L273 518 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 M0QZQ0 153 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BET1O15155 118 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ATP6V0E1O15342 81 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PDPK1O15530 556 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM189A1O60320 539 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MGEA5O60502 916 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF253O75346 499 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ULK1O75385 1050 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGHEP01854 428 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CTPS1P17812 591 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CD58P19256 250 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NPR2P20594 1047 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FUT3P21217 361 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPA1P27694 616 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HLA-FP30511 346 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TNFRSF4P43489 277 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ITGA8P53708 1063 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RAG2P55895 527 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FMODQ06828 376 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MGAT3Q09327 533 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OVGP1Q12889 678 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLA2G7Q13093 441 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BAMBIQ13145 260 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPS6KA1Q15418 735 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC22A6Q4U2R8 563 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM196Q5HYL7 178 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM102BQ5T8I3 360 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TSPO2Q5TGU0 170 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MANEALQ5VSG8 457 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GARNL3Q5VVW2 1013 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CES4AQ5XG92 561 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NCR3LG1Q68D85 454 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NOTUMQ6P988 496 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TLDC1Q6P9B6 456 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLXDC2Q6UX71 529 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZDHHC24Q6UX98 284 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PACS1Q6VY07 963 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC36A4Q6YBV0 504 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IL17RELQ6ZVW7 336 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BTN2A1Q7KYR7 527 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PIGZQ86VD9 579 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZSCAN30Q86W11 494 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C2CD5Q86YS7 1000 aa-0.88□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms